Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SPARCL1Q14515 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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