Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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UBE4AQ14139 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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UBE4AQ14139 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBE4AQ14139 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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UBE4AQ14139 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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UBE4AQ14139 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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UBE4AQ14139 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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UBE4AQ14139 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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UBE4AQ14139 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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UBE4AQ14139 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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UBE4AQ14139 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBE4AQ14139 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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