Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2H2Q13888 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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