Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MTMR3Q13615 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms