Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PMS2P3Q13401 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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