Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SRSF6Q13247 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SRSF6Q13247 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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