Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NME3Q13232 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NME3Q13232 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NME3Q13232 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NME3Q13232 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NME3Q13232 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms