Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CHAF1BQ13112 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CHAF1BQ13112 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms