Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHAF1AQ13111 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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