Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
IFT88Q13099 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IFT88Q13099 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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