Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CNTN1Q12860 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CNTN1Q12860 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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