Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPAL4Q0D2K0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPAL4Q0D2K0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms