Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
NCBP1Q09161 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms