Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM27E3Q08E93 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms