Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DHX9Q08211 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms