Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PDE4BQ07343 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms