Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABPAQ06546 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABPAQ06546 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms