Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC9Q06265 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC9Q06265 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms