Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6Q03468 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms