Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ID3Q02535 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ID3Q02535 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms