Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TNFRSF17Q02223 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF17Q02223 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms