Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM3Q01628 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
IFITM3Q01628 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms