Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPTBN1Q01082 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTBN1Q01082 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms