Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLTCQ00610 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLTCQ00610 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms