Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDC42EP1Q00587 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDC42EP1Q00587 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms