Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDK16Q00536 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDK16Q00536 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms