Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNAQ00169 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms