Protein–RNA interactions for Protein: P62834

RAP1A, Ras-related protein Rap-1A, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1AP62834 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAP1AP62834 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms