Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLRP11P59045 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLRP11P59045 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms