Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LOXL3P58215 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms