Protein–RNA interactions for Protein: P58005

SESN3, Sestrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SESN3P58005 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SESN3P58005 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SESN3P58005 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms