Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EDDM3BP56851 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms