Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BRPF1P55201 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BRPF1P55201 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms