Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms