Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKAA2P54646 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKAA2P54646 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms