Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ARFIP2P53365 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms