Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GBX2P52951 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX2P52951 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX2P52951 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX2P52951 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX2P52951 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX2P52951 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX2P52951 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX2P52951 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GBX2P52951 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GBX2P52951 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBX2P52951 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms