Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PGDP52209 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PGDP52209 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PGDP52209 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PGDP52209 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms