Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LUMP51884 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LUMP51884 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LUMP51884 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LUMP51884 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LUMP51884 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LUMP51884 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms