Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TGM4P49221 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms