Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TNNI2P48788 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNNI2P48788 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms