Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GABRA2P47869 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms