Protein–RNA interactions for Protein: P35913

PDE6B, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6BP35913 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDE6BP35913 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms