Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HOXC13P31276 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms