Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GCAP28676 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GCAP28676 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GCAP28676 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GCAP28676 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GCAP28676 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms