Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRKCHP24723 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms