Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GABRR1P24046 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GABRR1P24046 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms