Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HRCP23327 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HRCP23327 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HRCP23327 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HRCP23327 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HRCP23327 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HRCP23327 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HRCP23327 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HRCP23327 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HRCP23327 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HRCP23327 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms