Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EFNA1P20827 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EFNA1P20827 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms