Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CXCL3P19876 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms